Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms