Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms