Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Puf60Q3UEB3 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Puf60Q3UEB3 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Puf60Q3UEB3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Puf60Q3UEB3 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Puf60Q3UEB3 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Puf60Q3UEB3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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