Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Samd11Q1RNF8 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Samd11Q1RNF8 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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