Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccl7Q03366 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms