Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GscQ02591 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GscQ02591 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GscQ02591 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GscQ02591 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GscQ02591 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
GscQ02591 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GscQ02591 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GscQ02591 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GscQ02591 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GscQ02591 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms