Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grin2bQ01097 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms