Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms