Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Irx1P81068 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Irx1P81068 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irx1P81068 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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