Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx2P80206 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms