Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Srp9P49962 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms