Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PtpreP49446 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtpreP49446 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms