Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VdrP48281 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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VdrP48281 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VdrP48281 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VdrP48281 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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