Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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