Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Apoc1P34928 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms