Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165 ms