Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms