Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Irf1P15314 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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