Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gm2035J3QP87 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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