Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nccrp1G3X9C2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms