Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r167G3UW71 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms