Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
XntrpcF8VQM8 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms