Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ScaperF8VQ70 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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