Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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H2-M1F7CXU4 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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H2-M1F7CXU4 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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H2-M1F7CXU4 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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H2-M1F7CXU4 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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H2-M1F7CXU4 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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H2-M1F7CXU4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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H2-M1F7CXU4 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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H2-M1F7CXU4 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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H2-M1F7CXU4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2-M1F7CXU4 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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H2-M1F7CXU4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M1F7CXU4 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2-M1F7CXU4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
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H2-M1F7CXU4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M1F7CXU4 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M1F7CXU4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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