Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3371F7CQW8 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3371F7CQW8 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms