Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Gm17555F6U8B9 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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