Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3298E9PW80 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3298E9PW80 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms