Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms