Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Prrt4B2RU40 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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