Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zbed5B2RPU8 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms