Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Brpf3B2KF05 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms