Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssxb8B1AY40 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms