Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Atp8b5A3FIN4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Atp8b5A3FIN4 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Atp8b5A3FIN4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Atp8b5A3FIN4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Atp8b5A3FIN4 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Atp8b5A3FIN4 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Atp8b5A3FIN4 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Atp8b5A3FIN4 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Atp8b5A3FIN4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Atp8b5A3FIN4 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Atp8b5A3FIN4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atp8b5A3FIN4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms