Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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PtprfA2A8L5 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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PtprfA2A8L5 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprfA2A8L5 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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