Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd2Q9Z2E1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms