Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn8Q9Z260 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn8Q9Z260 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms