Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccne2Q9Z238 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccne2Q9Z238 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms