Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo3Q9Z172 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo3Q9Z172 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms