Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sema4fQ9Z123 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema4fQ9Z123 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms