Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
S1pr4Q9Z0L1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
S1pr4Q9Z0L1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 330.5 ms