Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zeb2Q9R0G7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zeb2Q9R0G7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zeb2Q9R0G7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms