Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc6Q9R087 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpc6Q9R087 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gpc6Q9R087 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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