Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a3Q9QZS0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3Q9QZS0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms