Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ClnkQ9QZE2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClnkQ9QZE2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClnkQ9QZE2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms