Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ercc4Q9QZD4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Ercc4Q9QZD4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ercc4Q9QZD4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ercc4Q9QZD4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms