Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Exo1Q9QZ11 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exo1Q9QZ11 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms