Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ndrg3Q9QYF9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ndrg3Q9QYF9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndrg3Q9QYF9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms