Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hacd1Q9QY80 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hacd1Q9QY80 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms