Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcb11Q9QY30 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Abcb11Q9QY30 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms