Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn4Q9QXZ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn4Q9QXZ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Opn4Q9QXZ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms